Sağlık Bilimleri Fakültesi Rektörlüğe bağlı olarak, 10.09.2012 tarihli ve 280407 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Bakanlar Kurulu Kararı ile kurulmuştur. İstanbul Aydın Üniversitesi Sağlık Bilimleri Fakültesi 2013 yılından beri öğrenci kabulüne başlamıştır. 2013 yılında ilk öğrencileri ile eğitim-öğretim faaliyetine başlayan Odyoloji, Sağlık Yönetimi Hemşirelik bölümlerini, 2015 yılında Sosyal Hizmet ve Fizyoterapi ve Rehabilitasyon bölümleri takip etmiştir. 2016 yılında Beslenme ve Diyetetik bölümü eğitim faaliyetlerine başlamıştır. Her yıl yeni açılan lisans ve yüksek lisans Türkçe programlarıyla Türkiye'nin en hızlı gelişen yüksek öğretim kurumları arasında yer almaktadır. Fakültemiz 2025-2026 öğretim yılında faaliyete geçen Fizyoterapi ve Rehabilitasyon ve Beslenme ve Diyetetik İngilizce programlarıyla dünyanın farklı bölgelerinden gelen uluslararası öğrenciler içinde önemli bir yüksek öğrenim kurumu olma yolunda emin adımlar atmaktadır. İstanbul Aydın Üniversitesi Sağlık Bilimleri Fakültesi bünyesinde Beslenme ve Diyetetik, Beslenme ve Diyetetik (İngilizce), Çocuk Gelişimi, Ebelik, Fizyoterapi ve Rehabilitasyon, Fizyoterapi ve Rehabilitasyon (İngilizce), Hemşirelik, Odyoloji, Sağlık Yönetimi ve Sosyal Hizmet bölümleri olmak üzere toplam on bölüm yer almaktadır.

​