İstanbul Aydın Üniversitesi Güzel Sanatlar Fakültesi'nin yönetim ve idari yapısı, karar alma ve uygulama süreçlerinde şeffaflık ve katılımcılığı esas alır. Fakülte yönetimi Dekan, Dekan Yardımcıları ve Fakülte Sekreteri tarafından yürütülür. Akademik süreçlerin planlanması, eğitim öğretim, araştırma ve toplumsal katkı faaliyetlerinin izlenmesi Fakülte Kurulu ve Fakülte Yönetim Kurulu aracılığıyla gerçekleştirilir. Bu kurullarda programları temsilen öğretim elemanları, akademik unvan temsilcileri ve öğrenci temsilcisi yer alarak paydaş temelli karar alma yaklaşımı desteklenir. Organizasyon şeması, görev dağılımını ve kurulların işleyişini açık biçimde göstermektedir.