Yatay geçiş; yurt içi, yurt dışı veya üniversite içindeki lisans programları arasında yapılabilmektedir. Yatay geçişle gelen öğrencilerin kabul ve kayıt işlemleri ilgili mevzuata göre gerçekleştirilir. Aynı bölüm veya programa yatay geçiş yapan öğrencilerde azami öğrenim süresi, öğrencinin önceki üniversitesine ilk kayıt yaptırdığı yıl esas alınarak hesaplanır. Farklı bir bölüm veya programa yatay geçiş yapılması durumunda ise öğrencinin önceki üniversitede geçirdiği süre dikkate alınmaz ve azami öğrenim süresi, İstanbul Aydın Üniversitesine kayıt yaptırdığı yıldan itibaren başlatılır. Yatay geçiş yapan öğrenciler, önceki üniversitelerinde alıp başarılı oldukları ve yeni programdaki derslerle eşdeğer kabul edilen derslerden muaf tutulur. Bu dersler, transfer zorunlu veya transfer seçmeli olarak, aldıkları harf notlarıyla birlikte transkripte işlenir ve genel not ortalamasına dâhil edilir.
Dikey geçiş ise ön lisans programlarından mezun olan öğrencilerin lisans programlarına yerleşmesi şeklinde uygulanır. Dikey geçişle lisans programına kabul edilen öğrencilerin intibak işlemleri ilgili mevzuat hükümlerine göre yapılır. Ön lisans eğitimi sırasında alınmış ve lisans programındaki derslerle eşdeğer olan derslerden muafiyet sağlanır ve öğrencinin hangi yarıyıldan öğrenime devam edeceği bu muafiyetler dikkate alınarak belirlenir. Muaf olunan dersler, ön lisans döneminde alınan harf notlarıyla birlikte lisans transkriptine aktarılır. Dikey geçiş yapan öğrencilerin ağırlıklı genel not ortalaması, hem ön lisanstan intibak edilen dersler hem de lisans eğitiminde alınan dersler üzerinden hesaplanır. Yabancı dille eğitim yapılan programlarda veya zorunlu yabancı dil hazırlık sınıfı bulunan bölümlerde, dikey geçişle gelen öğrencilerin lisans eğitimine başlayabilmeleri için üniversitenin yabancı dil muafiyet sınavını geçmeleri ya da hazırlık sınıfını başarıyla tamamlamaları zorunludur. Bu öğrenciler, öğrenimlerine 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu’nun ilgili hükümleri çerçevesinde devam ederler.